Sur le fleuve, juste en face du temple, de petits îlots et des bandes de sable sont visibles la plus grande partie de l'année. Dans l'Antiquité, elles abritaient de nombreux crocodiles et la ville était étroitement associée à Sobek, le dieu crocodile. Ainsi le temple est double : sa moitié gauche (Est) est consacrée à Horus l'ancien, Haroëris et sa moitié droite (Ouest) à Sobek.

Le plan de ce temple le rapproche de celui d'Edfou. Un pylône, une cour à péristyle, puis au-delà du pronaos (salle hypostyle), une succession de pièces flanquées de salles annexes conduisant aux sanctuaires des deux divinités tutélaires, Horus et Sobek.

Le pylône construit au 1er siècle de notre ère a disparu. La cour était bordée sur trois côtés d'un péristyle dont subsistent quelques fûts de colonnes présentant de beaux reliefs profondement creusés.

La salle hypostyle conserve une grande partie de son plafond, orné de scènes astronomiques ; il est soutenu par des colonnes fasciculées à chapiteaux ouverts.

Le roi fait des offrandes à Sobek et à Hathor.

Le roi Ptolemée XIII et les deux déesses se présentent devant Haroëris.